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校内外合作导师
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罗静
作者: 发布时间 : 2025-03-18 10:29:53 点击量:

 

罗静女,博士,19733月生,云南,国家自然科学基金获得者。现任云南大学教授,博士生导师(兼西联院)东陆骨干教授,云南省学术与技术带头人,生物学一级学科PI,动物学科方向学科带头人

主要从事动物遗传学领域的脊椎动物多倍化基因组学和生物信息学方面的研究。先后承担完成了NSFC重大研究计划集成培育项目和集成项目、NSFC云南省联合基金重点项目、NSFC面上项目等10余项;SCI刊物上发表50余篇出版专著1部。省部委云南省自然科学一等奖和伍达观教育基金优秀教师二等奖

多倍化脊椎动物的基因组演化研究方面取得了突出成绩,主要包括以下几个方面:

1对经历多次多倍化的鲤科鱼类展开基因组学和转录组学研究,解析人工杂交多倍化鱼类的繁育与组学特征

2特殊适应性鱼类的基因组演化,世界上最小鱼类Minifish基因组小型化及酸性适应机制的研究,鲤科鱼类对污染水环境适应机制的研究

3DNA结构和RNA调控功能相关的生物信息学,研究在三维结构和互作网络中研究遗传信息的调控表达。

4生物信息学及组学相关软件的研发。

 

联系方式

E-mail: jingluo@ynu.edu.cn

 

学历(从本科开始按按时间正序填写)

1992.091996.07: 云南大学,微生物专业,获理学学士学位

1996.092002.06: 中国科学院昆明动物研究所,动物学专业,获理学博士学位

 

主持或承担的科研项目(按时间正序填写)

2014-2016年:国家自然科学基金重大研究计划培育项目:异源杂交多倍化鲫鲤初期不同世代的遗传变化规律研究,No.91331105,项目负责人,经费120万元。

2017-2019年:国家基金重大计划集成项目,异源杂交鲫鲤体系不同世代基因组初期变化及其遗传稳定性研究,No.91631305项目负责人,经费245.1元。

2020-2023年:NSFC-云南省联合基金项目,高原湖泊水质变化过程中鲫鱼复合种群体多样性变化及其生态适应性No.U190220091,项目负责人,经费231元。

2023-2027年:NSFC重大项目远缘杂交鱼类分子遗传规律研究课题3,远缘杂交二倍体和三倍体鱼优势性状的关键功能基因及调控机制,No.32294325012,课题负责人,经费533元。

2023-2025年:云南大学“双一流”建设联合专项-重大项目,高度复杂基因组格局下远缘杂交品种生长优势性状的深度学习探究,No.212010803065,项目负责人,经费200元。

 

社会兼职(按时间正序填写)

云南省科学技术奖励委员会,云南省科学技术奖励专业评审委员会委员。

西南联合研究生院,研究生导师。

Reproduction and Breeding编委。

 

获奖情况(按时间正序填写)

省部委云南省自然科学一等2010年)。

伍达观教育基金优秀教师二等奖2016

获云南省中青年学术技术带头人称号(2021

云南大学东陆骨干教授(2022

 

参加编写的主要论著:

1. 周维,罗静.2022.深度学习在生物信息学中的研究与应用.科学出版社.

年发表主要学术论文

1. Lin G.,#, Huang Z.,#, Yue T.,#, Chai J.,#, Li Y.,#, ..., Luo J.,#, et al. (2024) Puzzle Hi-C: An accurate scaffolding software. PLoS One. 19(7): e0298564.

2. Chen Y.,#, Yue T.,#, Lin G.,#, ..., Luo J.,*, et al. (2023) Transcriptome analysis confirms aquatic animals have less risk by carrying on human respiratory viruses. Reprod Breed. 3(4):161-168.

3. Li Y.,*#, Wang S.,#, Zhang Z.,#, Luo J.,#, et al. (2023) Large-Scale Chromosomal Changes Lead to Genome-Level Expression Alterations, Environmental Adaptation, and Speciation in the Gayal (Bos frontalis). Mol Biol Evol, 40(1): msad006.

4. Zhong, H., Luo, J., et al. (2023) Association filtering and generative adversarial networks for predicting lncRNA-associated disease. BMC Bioinformatics. 24(1):234.

5. Lu, Z., LuoJ., et al. (2023) Predicting lncRNA-disease associations based on heterogeneous graph convolutional generative adversarial network. PLoS Comput Biol. 19(11): e1011634. 

6. Luo, J.#, Chai, J.#, Wen, Y.#, Tao, M.#, Lin, G.#, Liu, X., ... & Wang, Y. (2020). From asymmetrical to balanced genomic diversification during rediploidization: Subgenomic evolution in allotetraploid fish. Science Advances, 6(22), eaaz7677.

7. Xu, P., Xu, J., Liu, G., Chen, L., Zhou, Z., Peng, W., ..., Luo, J.... & Wu, Y. (2019). The allotetraploid origin and asymmetrical genome evolution of the common carp Cyprinus carpio. Nature communications, 10(1), 1-11.

8. Yin, F., Liu, W., Chai, J., Lu, B., Murphy, R. W., & Luo, J.* (2018). CRISPR/Cas9 application for gene copy fate survey of polyploid vertebrates. Frontiers in genetics, 9, 260.

9. Zhou, W., Li, R., Yuan, S., Liu, C., Yao, S., Luo, J.*, & Niu, B.* (2017). MetaSpark: a spark-based distributed processing tool to recruit metagenomic reads to reference genomes. Bioinformatics, 33(7), 1090-1092.

10. 10. Ren, L., Li, W., Tao, M., Qin, Q., Luo, J., Chai, J., ... & Zhang, C. (2016). Homoeologue expression insights into the basis of growth heterosis at the intersection of ploidy and hybridity in Cyprinidae. Scientific reports, 6(1), 1-12.

11. Bryant, J. V., Gottelli, D., Zeng, X., Hong, X., Chan, B. P. L., Fellowes, J. R., ..., Luo, J., ... & Chatterjee, H. J. (2016). Assessing current genetic status of the Hainan gibbon using historical and demographic baselines: implications for conservation management of species of extreme rarity. Molecular ecology, 25(15), 3540-3556.

12. Lin, G., Chai, J., Yuan, S., Mai, C., Cai, L., Murphy, R. W., ... & Luo, J.* (2016). VennPainter: a tool for the comparison and identification of candidate genes based on venn diagrams. PLoS One, 11(4), e0154315.

13. Liu, S.#Luo, J.#, Chai, J.#, Ren, L.#, Zhou, Y.#, Huang, F.#, ... & Lu, B. (2016). Genomic incompatibilities in the diploid and tetraploid offspring of the goldfish× common carp cross. Proceedings of the National Academy of Sciences, 113(5), 1327-1332.

14. Wang, J., Lu, B., Zan, R., Chai, J., Ma, W., Jin, W., ..., Luo, J., ... & Chen, Z. (2016). Phylogenetic relationships of five asian schilbid genera including Clupisoma (Siluriformes: Schilbeidae). PloS one, 11(1), e0145675.

15. Chai, J., Su, Y., Huang, F., Liu, S., Tao, M., Murphy, R. W., & Luo, J.* (2015). The gap in research on polyploidization between plants and vertebrates: model systems and strategic challenges. Science Bulletin, 60(17), 1471-1478.

16. Ma W#Zhu ZH#Bi XYMurphy RWWang SYGao YXiao HZhang YP*, Luo J*. (2014)Allopolyploidization is not so simple: evidence from the origin of the Tribe Cyprinini (Teleostei: Cypriniformes). Current Molecular Medicine 141331-1338.

17. Luo J#, Gao Y#, Ma W, Bi XY, Wang SY, Wang J, Wang YQ, Du R, Meyer A, ZanRG, Xiao H, Murphy RW, Zhang YP*. (2014). Tempo and mode of recurrentpolyploidization in the Carassius auratus species complex (Cypriniformes, Cyprinidae). Heredity 112: 415-427.

 


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